Der Charme von Nosy Be wurde bereits 1649 geschätzt, als der englische Colonel Robert Hunt schrieb: "Ich glaube, und schwöre bei Gott, dass kein Teil der Welt besser für Plantagen geeignet ist als diese Insel; ein Land, das sowohl für Vergnügen als auch für Profit perfekt scheint." Hunt versuchte, eine Kolonie auf der Insel zu gründen, die Assada genannt wurde, aber sein Plan scheiterte bald aufgrund der Feindseligkeit der Einheimischen und Krankheiten. Spätere Einwanderungen trugen zur Vielfalt der Rassen auf Nosy Be bei.
Nosy Be trat in die schriftliche Geschichte Madagaskars ein, als König Radama I.
vorgeschlagen, den westlichen Teil der Insel Madagaskar zu erobern, mit dem Ziel, das Meer von innen zu erreichen. Er führte seinen Plan erfolgreich durch und erlangte die Kontrolle über das Sakalava-Königreich von Boina. Es war im Jahr 1830, als König Radama I.
versuchte, alle Stämme Madagaskars unter seiner Herrschaft zu vereinen.
Im Jahr 1839, nach der Niederlage durch die Merina, nahm Königin Tsyomeko der Sakalava, begleitet von vielen Anhängern, Zuflucht auf den Inseln Nosy Komba und Tanikely. Die Merina waren nicht in der Lage, ihnen bis zu diesen Inseln zu folgen, setzten sich jedoch an der nahegelegenen Küste fest und hielten die Sakalava weiterhin unter Bedrohung. Nosy Be suchte Hilfe beim Sultan von Sansibar, aber dieser, nicht wissend, dass die Feinde der Merina aus den Hochländern kamen, sandte fälschlicherweise ein Kriegsschiff, um etwaige Versuche einer maritimen Eroberung abzuschrecken. Im Jahr 1840 ankorte das französische Kriegsschiff "Colibri" in der Bucht von Nosy Be, und die Sakalava wandten sich an den Kommandanten, um Schutz von Frankreich zu suchen.
Diese Gelegenheit ergriff Kapitän Passot und sandte eine Nachricht an Admiral Hell, den Gouverneur der Insel Bourbon (heute Réunion), der, genauso wie Passot, die Chance erkannte und unterzeichnete.
einen Vertrag, der das Protektorat über das Sakalava-Königreich festlegte. Im Jahr 1841 traten die Sakalava sowohl Nosy Be als auch das nahegelegene Nosy Komba an Frankreich ab. Kapitän Passot und Admiral Hell würden in Nosy Be in Erinnerung bleiben, mit den Namen, die ihnen zugeordnet wurden: Mont Passot und die Hauptstadt der Insel, Hell-Ville. Das französische Protektorat war jedoch von vielen Jahren der Unruhe geprägt, einschließlich Vorfällen und Raubzügen. Am 26. Juni 1960 erlangten Nosy Be und ganz Madagaskar die Unabhängigkeit von der französischen Kolonialisierung durch General De Gaulle.
Eine der unglaublichsten Geschichten ist die der russischen Kriegs fregatte, die vom Zaren während des Russisch-Japanischen Krieges von 1904-1905 nach Nosy Be geschickt wurde. Die Mission war, den Kanal von Mosambik vor japanischen Eindringlingen zu schützen. Nach dem Kriegsende wurde das russische Schiff vom Zaren vergessen, und die unglücklichen Männer des Kontingents blieben gestrandet, ohne zu wissen, dass ihr Herrscher den Frieden unterschrieben hatte. Sie siedelten sich in Nosy Be an, wo die meisten von ihnen an Malaria, Typhus und anderen tropischen Krankheiten starben. Sie sind immer noch in einer Ecke des riesigen Friedhofs in Hell-Ville beigesetzt.